PCR中的DNA聚合酶,你选对了吗?”
CR(聚合酶链式反应)对于常年在实验室里狂奔的实验犬来说并不陌生。那么,您是否选择了正确的 DNA 聚合酶(PCR 反应的核心成分)?
常见的DNA聚合酶如Taq、Phanta、Pfu、KOD、Primerstar、Klenow、Bst、Phi29等。根据耐热性可分为耐热酶和室温酶。耐热聚合酶如Taq、Pfu、KOD、Primerstar等,室温聚合酶有Klenow、Bst、Phi29等。按照保真度分,高保真聚合酶Pfu、KOD、Phanta等,常见聚合酶Taq , ETC。
面对如此多的选择,大多数刚进入实验室的新生都默默地表达着对选择的恐惧和承诺……
因此,解决的办法是根据实验目的选择合适的DNA聚合酶。例如:常规PCR扩增和菌液鉴定,对于长度小于5kb的片段保真度要求不高,可以使用Taq酶进行扩增。使用Mix格式使样品混合更简单,操作更方便。如果混合物含有大量泡沫并且您想消除泡沫,建议您使用 Green Taq Mix。如果想要获得更高的产量,可以选择Taq Plus DNA聚合酶,它比Taq酶具有更强的扩增性能。
1、选择热启动酶,减少非特异性扩增
使用Taq酶进行扩增时,有时会出现非特异性扩增。可能的原因可以从模板、引物、系统、程序一一排查。例如,模板是否被污染、引物的特异性如何、Mg2+浓度是否高等。不可忽视的原因之一是DNA聚合酶的类型是否合适。如果排除其他原因后仍然存在非特定产物,可以选择热启动酶并重新实验,这样可以有效减少或消除系统中其他产物的积累。常用的热启动酶分为两类:一类是化学修饰的热启动酶,如Ace Taq,在95℃预变性后可释放酶活性。°C 5-10分钟;另一种是抗体修饰的热启动酶。例如Champagne Taq可以通过在95℃预变性来释放酶活性°C 30秒。使用时要注意预变性时间,以获得满意的扩增结果。
2. 选择Lamp来放大长片段
如何扩增大于5Kb的长片段?如果您的实验不需要高保真度,则可以使用 LAmp DNA 聚合酶。其保真度是Taq酶的6倍,可以扩增超过20Kb的基因组和cDNA片段。对于低拷贝、低纯度、不同GC含量的模板有较高的成功率。
3. 选择高保真酶,快速高效扩增
如果实验要求高保真度,在选择DNA聚合酶时需要使用高保真酶,如Pfu、KOD、Primerstar、Phanta等。前三种都是第一代高保真酶,已广泛应用于市场。Novozant科研团队经过大力改造生产的Phanta系列高保真酶,保真度是Taq酶的50倍,扩增性能、扩增长度、产量、模板适应性等均得到显着提升。Phanta Max 的保真度是 Taq 酶的 53 倍,Pfu 的 6 倍。质粒等简单模板的有效扩增长度可达40kb,cDNA的有效扩增长度可达10kb,基因组的有效扩增长度可达20kb。适用于各种GC含量的扩增,可用于植物叶片、全血等多种样品的直接PCR,且扩增只需30s/kb,甚至2kb/s。如此出色,让你爱不释手,对吧?
4. 选择直接扩增试剂盒对粗产物进行扩增
xxx生产的各种直接扩增试剂盒直接对粗品进行扩增,大大缩短了实验工作周期。例如,One Step Mouse Genotyping Kit可直接用于小鼠基因分型,Blood Direct PCR Kit V2可直接用于全血扩增。